Pelayanan yang ada di Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Banjarmasin, yaitu :
1. Pelayanan Kekarantinaan Kesehatan
2. Pelayanan Vaksinasi Internasional (Meningitis Meningococcus dan Yellow Fever) dan Vaksinasi Lainnya (Influenza dan Thypoid)
3. Pelayanan Pemeriksaan dan Pengobatan Terbatas